שחלוף זנים
Effectiveness of monovalent rotavirus vaccine (Rotarix) against severe diarrhea caused by serotypically unrelated G2P[4] strains in Brazil.
2010,
Correia,
J Infect Dis
בברזיל זן רוטה (G2P(4 שלפני ההתחסנות חלקו היחסי היה 19%-30%, החליף את כל הזנים אחרים ב-15 החודשים שלאחר תחילת ההתחסנות. יעילות החיסון (רוטריקס) כנגד אותו הזן עמדה על 77% בגילאי 6-11 חודשים, ועל 24%- (יעילות שלילית) עבור ילדים מעל גיל 12 חודשים. עוד: [1], [2].
כאן מדווח כי אחרי תחילת התחסנות בברזיל זני נגיף הרוטה הרגילים הוחלפו בזן חדש (G12P(8. שחלוף הזנים התרחש גם בפרגוואי ובארגנטינה.
Detection of rotateq vaccine-derived, double-reassortant rotavirus in a 7-year-old child with acute gastroenteritis.
2014,
Hemming,
Pediatr Infect Dis J
הגנום של רוטה-וירוס מורכב ממספר מקטעים, וכששני זנים של הנגיף מדביקים את אותו התא הם מסוגלים להחליף מקטעים ביניהם וליצור זן חדש. זהו אותו תהליך הרה-אסורטציה שבו יצרו את הזנים החיסוניים, רק שהתהליך הזה מתנהל באופן לא מבוקר.
מאמר זה מדווח על מקרה דלקת מעי בילדה בת 7. בבדיקת צואה נמצא זן של נגיף הרוטה שנוצר בתהליך רה-אסורטציה משני זנים רה-אסורטיביים (אנושי-בקר) של חיסון הרוטטק. אלא שהילדה לא הייתה מחוסנת בחיסון הזה. יתרה מזאת, היא לא הייתה במגע עם אדם מחוסן כלשהו. לשני אחיה היו תסמיני דלקת מעי דומים, גם הם לא היו מחוסנים ולא היו במגע עם אנשים מחוסנים.
הזן הרה-אסורטנטי שזוהה נתגלה כיציב ומאוד מדבק. המחברים סבורים כי הזן הזה כנראה מופץ באוכלוסיה. זנים רה-אסורטנטיים כבר נמצאו בעבר, אך בניגוד למקרה הזה – רק במי שחוסן ברוטטק לאחרונה: [1], [2], [3].
כאן מדווח על גילוי זני רוטה-וירוס חדשים שנוצרו כתוצאה מרה-אסורטציה של זן רוטה פראי עם זן חיסוני מרוטריקס.
כאן מדווח כי 17% מהילדים הפרישו את הנגיף לאחר שחוסנו, ו-37% מתוכם הפרישו זן שהוא תוצאה של תהליך רה-אסורטנטי כפול. מספר ילדים הפרישו את הנגיף זמן רב לאחר החיסון, בין 9 עד 84 ימים אחרי קבלת המנה האחרונה.
Vaccine-derived NSP2 segment in rotaviruses from vaccinated children with gastroenteritis in Nicaragua.
2012,
Bucardo,
Infect Genet Evol
המחברים ניתחו את הגנום של נגיפי הרוטה שבודדו מילדים מחוסנים בניקרגואה שסבלו מדלקות מעי, וגילו זני נגיף חדשים אשר נוצרו בתהליך רה-אסוארטציה בין זן פראי לזנים החיסוניים של רוטטק.
Identification of strains of RotaTeq rotavirus vaccine in infants with gastroenteritis following routine vaccination.
2012,
Donato,
J Infect Dis
מבין ילדים שסבלו משלשולים תוך שבועיים אחרי חיסון הרוטטק, זן רוטה-וירוס חיסוני נתגלה בקרב 21%. 37% מהזנים החיסוניים שבודדו היו זנים רה-אסורטנטיים שנתקבלו משני זנים של רוטטק.
Capsule switching of Neisseria meningitidis.
1997,
Swartley,
Proc Natl Acad Sci U S A
בדומה לפנאומוקוק, גם חיידקי מנינגוקוק מסוגלים לשנות את קבוצות הסרוטיפ שלהם.
Invasive meningococcal disease in Quebec, Canada, due to an emerging clone of ST-269 serogroup B meningococci with serotype antigen 17 and serosubtype antigen P1.19 (B:17:P1.19).
2006,
Law,
J Clin Microbiol
ב-2004 התרחשה בקוויבק התפרצות של זיהום מנינגוקוק מקבוצה B. המחברים סבורים כי הסיבה להתפרצות היא שחלוף זנים בעקבות התחסנות בחיסון פוליסכרידי נגד קבוצה C.
Prevalence of HPV After Introduction of the Vaccination Program in the United States.
2016,
Markowitz,
Pediatrics
בטבע כידוע אין ואקום. מניעת הידבקות בשניים או ארבעה זני נגיף הפפילומה גורמת לשחלוף זנים.
קיימת ירידה בשכיחות ההדבקות בארבעת הזנים המכוסים בחיסון בנערות מחוסנות, אך אין שום שינוי בשכיחות הנגיף אם לוקחים בחשבון את כל הזנים שלו.
Shift in prevalence of HPV types in cervical cytology specimens in the era of HPV vaccination.
2016,
Fischer,
Oncol Lett
הזנים האונקוגניים 16 ו-18 שוחלפו ע"י זנים אונקוגניים אחרים: 31, 51, 53, 56 ו-66.
עוד שלושה מחקרים עם מסקנות דומות שנערכו באיטליה, הולנד וארה"ב.
Changing epidemiology of invasive Haemophilus influenzae in Ontario, Canada: evidence for herd effects and strain replacement due to Hib vaccination.
2010,
Adam,
Vaccine
החיסון הוריד את התחלואה ב-HiB באונטריו, קנדה ב-57%, אך התחלואה בסרוטיפ F עלתה פי 2.4, והתחלואה בזנים נטולי קפסולה עלתה פי 3. התחלואה ב-HiB פחתה ב-7% בשנה בילדים מתחת לגיל 5, ואילו התחלואה בזנים נטולי קפסולה גדלה ב-7% בשנה בילדים בגילאים 5-19. בסיכומו של דבר התחלואה בהמופילוס אנפלואנזה כמעט ולא השתנתה, רק שכמות מקרי דלקת קרום המוח ירדה וכמות מקרי אלח-דם עלתה.
זנים נטולי קפסולה נמצאים בדרכי נשימה עליונות של 65% מהילדים.
Prevention of Haemophilus influenzae type b (Hib) meningitis and emergence of serotype replacement with type a strains after introduction of Hib immunization in Brazil.
2003,
Ribeiro,
J Infect Dis
שנה לאחר תחילת החיסון בברזיל כמות מקרי דלקת קרום המוח הנגרמת ע"י HiB פחתה ב-69% (מ-2.62 ל-0.81 ל-100,000). כמות מקרי דלקת קרום המוח הנגרמת ע"י HiA עלתה פי 8 (מ-0.02 ל-0.16 ל-100,000).
מבחינה קלינית הוירולנטיות של HiB ו-HiA אינה שונה. התמותה כתוצאה מ-HiA עמדה על 23%.
Haemophilus influenzae Serotype a Invasive Disease, Alaska, USA, 1983-2011.
2013,
Bruce,
Emerg Infect Dis
באלסקה, לפני שהחלו לחסן, התחלואה ב-HiB הייתה הגבוהה בעולם. הודות לחיסון כמות מקרי HiB ירדה בחדות, אך עלתה התחלואה כתוצאה מסרוטיפים אחרים, בעיקר A, ומהזנים נטולי קפסולה.
Invasive Haemophilus influenzae disease in adults.
2000,
Sarangi,
Epidemiol Infect
באנגליה כמות מקרי HiB בקרב המבוגרים (גיל 15 ומעלה) פחתה בעקבות החיסון, אך התחלואה הכללית בהמופילוס אינפלואנזה עלתה בשל עלייה חדה בכמות מקרי מחלה בזנים נטולי קפסולה, במיוחד בקרב הקשישים. התמותה עמדה על 59%.
Trends in Haemophilus influenzae type b infections in adults in England and Wales: surveillance study.
2004,
McVernon,
BMJ
באנגליה התחלואה ב-HiB בקרב המבוגרים פחתה לאחר תחילת החיסונים (ככל הנראה בגלל אפקט חסינות העדר), הגיעה לשפל ב-1998, אך כבר ב-2003 חזרה לרמה המקורית.
כמות הנוגדנים ל-HiB במבוגרים ירדה אחרי תחילת החיסונים. תופעה דומה התרחשה בקרב הילדים. תחילה התחלואה ב-HiB ירדה בחדות אך לאחר מכן החלה לעלות בחדות למרות היקף חיסוני גבוה.
מאז 1998 מספר מקרי המחלה בקרב ילדים מוכפל מדי שנה, ובמרבית המקרים החולים היו מחוסנים באופן מלא.
Increasing incidence of invasive Haemophilus influenzae disease in adults, Utah, USA.
2011,
Rubach,
Emerg Infect Dis
החיסון הפחית כמות מקרי HiB בילדים ב-99%, אך התחלואה בהמופילוס אינפלואנזה בקרב מבוגרים עלתה פי 11.5 בין 1998 לבין 2008. רוב התחלואה נגרמה ע"י סרוטיפ F וזנים נטולי קפסולה. התמותה עמדה על 22%.
Invasive Haemophilus influenzae in British Columbia: non-Hib and non-typeable strains causing disease in children and adults.
2011,
Shuel,
Int J Infect Dis
ב-1989, לפני שהחלו לחסן בקנדה, בקולומביה הבריטית נרשמו 24 מקרי HiB בשנה. ב-2008-2009 נרשמו 45-53 מקרים בשנה. התחלואה ב-HiB פחתה ואילו התחלואה ב-HiA עלתה. אם בעבר חלו בעיקר ילדים אזי עכשיו גם המבוגרים החלו לחלות.
The changing epidemiology of invasive Haemophilus influenzae disease, especially in persons > or = 65 years old.
2007,
Dworkin,
Clin Infect Dis
מ-1996 ועד 2004 כמות מקרי HiB באילינוי, ארה"ב גדלה פי 2.5, ובקרב המבוגרים – פי 3.5.
התחלואה בזנים נטולי קפסולה עלתה ב-657%. אם ב-1996 HiB נטול קפסולה היה גורם ל-17% מהמקרים, ב-2004 הוא היה גורם כבר ל-70% מהמקרים. התמותה עמדה על 13%, ובקרב הקשישים – 21%.
התמותה כתוצאה מסרוטיפ F עמדה על 11% בקרב הקשישים, ומסרוטיפ E על 38%.
Invasive disease due to Haemophilus influenzae serotype f: clinical and epidemiologic characteristics in the H. influenzae serotype b vaccine era. The Haemophilus influenzae Study Group.
1996,
Urwin,
Clin Infect Dis
בין 1989 ל-1994 התחלואה בסרוטיפ F עלתה פי 3.8 ועומדת כעת על 17% מכל מקרי המופילוס אינפלואנזה. התמותה כתוצאה מהסרוטיפ הזה עומדת על 30% בקרב המבוגרים ועל 21% בקרב הילדים.
Increase in the number of invasive Haemophilus influenzae type b infections.
2005,
Spanjaard,
Ned Tijdschr Geneeskd
בהולנד אחרי תחילת החיסון התחלואה ב-HiB פחתה, ירדה למינימום ב-1993 ואז החלה לעלות. הסיבה לכך כנראה היא שבגלל העלמות החיידק החשיפה הטבעית אליו פחתה, מה שגרם לאיבוד החסינות אליו ורגישות מוגברת לזיהום.
ואולי זה קרה בגלל שהחיסון הכחיד את הזנים בעלי קפסולה דקה והשאיר זנים עם קפסולה עבה יותר. עוד: [1], [2], [3].
Epidemiology of invasive pneumococcal and Haemophilus influenzae diseases in Northwestern Ontario, Canada, 2010-2015.
2017,
Eton,
Int J Infect Dis
באונטריו התחלואה בסרוטיפ A כבר עולה ב-76% על התחלואה ב-HiB שהיתה לפני תחילת החיסון.
עוד מספר מאמרים על שחלוף הזנים מסרוטיפ B לסרוטיפים אחרים: [1], [2], [3], [4], [5], [6], [7], [8], [9], [10], [11].
Rapid pneumococcal evolution in response to clinical interventions.
2011,
Croucher,
Science
בתגובה לשימוש באנטיביוטיקה ובחיסונים הפנאומוקוק עובר מוטציות במהירות. חיידקי פנאומוקוק מסוגלים לשנות את הסרוטיפ שלהם.
Emergence of Multidrug-Resistant Pneumococcal Serotype 35B among Children in the United States.
2017,
Olarte,
J Clin Microbiol
לאחר תחילת התחסנות נוצר סרוטיפ חדש 35B שתחילה לא היה נפוץ אך משנה לשנה גורם לכמויות רבות יותר של זיהומים פנאומוקוקיים. הסרוטיפ הזה קטלני פי 5 משאר הסרוטיפים ולעתים קרובות עמוד לאנטיביוטיקה.
התחלואה בפנאומוקוק ירדה פי 2 תוך שנתיים אחרי תחילת החיסון, ונותרה מאז ברמה קבועה. עוד: [1].
Emergence of invasive pneumococcal disease caused by nonvaccine serotypes in the era of 7-valent conjugate vaccine.
2008,
Muñoz-Almagro,
Clin Infect Dis
בברצלונה אחרי תחילת החיסון התחלואה בזיהומים פנאומוקוקיים עלתה ב-58%, ובקרב הילדים – ב-135%.
התחלואה בסרוטיפים מהחיסון ירדה ב-40%, ואילו התחלואה בסרוטיפים שלא נכללו בחיסון עלתה ב-531%.
התחלואה בדלקות ריאות וסיבוכי הצטברות מוגלה עלתה ב-320% בקרב ילדים מתחת לגיל 5.
Temporal trends of invasive disease due to Streptococcus pneumoniae among children in the intermountain west: emergence of nonvaccine serogroups.
2005,
Byington,
Clin Infect Dis
בסולט-לייק-סיטי (יוטה) כמות מקרי זיהום פנאומוקוקי ירדה בין 1997 ל-2003 ב-27% אחרי תחילת החיסון. החלק היחסי של הסרוטיפים שנכללו בחיסון ירד מ-73% ל-50%. כמות מקרי זיהום פנאומוקוקי מסרוטיפים שלא בחיסון עלתה פי 3. משך האשפוז הממוצע היה ארוך יותר בילדים שחלו בסרוטיפים שלא נכללים בחיסון.
החלק היחסי של סיבוכי הצטברות מוגלה מסביב לריאות עלה מ-16% ל-30%, והחלק היחסי של דלקות ריאות קשות עלה מ-57% ל-71%. עוד: [1].
Invasive pneumococcal disease caused by nonvaccine serotypes among Alaska native children with high levels of 7-valent pneumococcal conjugate vaccine coverage.
2007,
Singleton,
JAMA
ילדי האוכלוסיה האבוריג'נית באלסקה לוקים בזיהומים פנאומוקוקיים פולשניים פי 3 יותר מאשר בממוצע בארה"ב.
תוך 3 השנים הראשונות מאז תחילת ההתחסנות (2001-2003) התחלואה בזיהומי פנאומוקוק בילדי אבוריג'נים מתחת לגיל שנתיים ירדה ב-67%. אך לאחר מכן בשנים 2004-2006 התחלואה עלתה ב-82%. התחלואה בסרוטיפים שבחיסון ירדה ב-96% והתחלואה בסרוטיפים שבחיסון עלתה ב-140%.
כמות המקרים עם סיבוכים מוגלתיים עלתה מ-2% ל-13%. החלק היחסי של דלקות ריאות עם זיהומי דם עלה מ-40% ל-57%.
ב-2004 41% מהאוכלוסיה היו נשאים של הפנאומוקוק. החלק היחסי של שבעת הסרוטיפים המכוסים ע"י החיסון ירד מ-41% ל-5%, והחלק היחסי של הסרוטיפים שלא מכוסים עלה מ-47% ל-88%.
The epidemiology of invasive pneumococcal disease in British Columbia following implementation of an infant immunization program: increases in herd immunity and replacement disease.
2012,
Sahni,
Can J Public Health
בין 2002 ל-2010 התחלואה בזיהום פנאומוקוקי פולשני ירדה ב-78% בקרב ילדים מתחת לגיל 5, אך עלתה בקרב ילדים מעל גיל 5, במבוגרים ובקשישים. הזנים המכוסים בחיסון התחלפו בזנים שלא מכוסים. בספירה הכללית התחלואה לא השתנתה.
ב-2006--2007 נרשמה התפרצות פנאומוקוק בחסרי בית ומכורים לסמים (קולומביה בריטית, קנדה).
The changing role of exposure to children as a risk factor for bacteremic pneumococcal disease in the post conjugate vaccine era.
2010,
Metlay,
Arch Intern Med
בתקופה שבין 2002 ו-2008 בפילדלפיה התחלואה בסרוטיפים חיסוניים בקרב המבוגרים ירדה ב-29% בשנה, והתחלואה בסרוטיפים לא-חיסוניים עלתה ב-13% לשנה. בספירה הכללית, התחלואה בזיהום פנאומוקוקי עלתה ב-7% מידי שנה.
האפרו-אמריקאים חלו פי 2 מהלבנים. ככל שהיו במשפחה יותר ילדים, כך הסיכון לזיהום פולשני היה נמוך יותר.
סכרת מעלה את הסיכון למחלה פי 2.5, עישון – פי 2.2.
עוד מספר מאמרים הדנים בהחלפת הזנים שבחיסון ע"י הזנים שלא נכללים בחיסון: [1], [2], [3], [4], [5], [6], [7], [8], [9], [10], [11], [12], [13], [14], [15], [16], [17].
...ובהחלפת הפנאומוקוק בהמופילוס אינפלונזה וחיידקים אחרים: [1], [2], [3], [4], [5], [6], [7].
Carriage of pneumococci after pneumococcal vaccination.
1996,
Obaro,
Lancet
מכיוון שזיהום פולשני אפשרי רק בתנאי שקיימת התיישבות החיידק בלוע, אחת המטרות של החיסון היא גם להוריד את נשאות הפנאומוקוק.
החיסון המצומד נוסה לראשונה ב-1993 בגאמביה, אז הסתבר כי הנשאות של הסרוטיפים החיסוניים ירדה ב-78%-89% ואילו הנשאות של הסרוטיפים האחרים עלתה ב-550%.
Carriage of Haemophilus influenzae is associated with pneumococcal vaccination in Italian children.
2015,
Camilli,
Vaccine
באיטליה לא היה הבדל בנשאות הפנאומוקוק בין המחוסנים ללא-מחוסנים. המופילוס אינפלואנזה נמצא הרבה יותר בקרב המחוסנים.
Effect of 10-valent pneumococcal conjugate vaccine on nasopharyngeal carriage of Streptococcus pneumoniae and Haemophilus influenzae among children in São Paulo, Brazil.
2016,
Brandileone,
Vaccine
לאחר תחילת ההתחסנות הנשאות של הסרוטיפים החיסוניים ירדה באופן משמעותי ואילו הנשאות של שאר הסרוטיפים עלתה. המופילוס אינפלואנזה נמצא פי 2-5 יותר בקרב המחוסנים (סאן-פאולו, ברזיל).
Post-PCV7 changes in colonizing pneumococcal serotypes in 16 Massachusetts communities, 2001 and 2004.
2005,
Huang,
Pediatrics
במסצ'וסטס, ארה"ב, בין 2001 ל-2004 הנשאות של שבעת הסרוטיפים החיסוניים בקרב ילדים מתחת לגיל 7 ירדה, ונשאות של הסרוטיפים האחרים עלתה. באופן כללי הנשאות של הפנאומוקוק כמעט ולא השתנתה. העמידות לפניצילין עלתה מ-8% ל-25% בסרוטיפים הלא-חיסוניים, ומ-45% ל-56% בסרוטיפים החיסוניים.
Continued impact of pneumococcal conjugate vaccine on carriage in young children.
2009,
Huang,
Pediatrics
המשך המחקר הקודם. לקראת 2007 הסרוטיפים החיסוניים כמעט נכחדו והתחלפו בסרוטיפים הלא-חיסוניים והעמידים לפניצילין. בספירה הכללית היקף הנשאות של הפנאומוקוק נותר על 30% אך הוא גדל משמעותית בקרב ילדים מתחת לגיל 6 חודשים.
Impact of 13-Valent Pneumococcal Conjugate Vaccination on Streptococcus pneumoniae Carriage in Young Children in Massachusetts.
2014,
Lee,
J Pediatric Infect Dis Soc
גם החיסון המכסה 13 סרוטפים (PCV13) לא שינה את היקף הנשאות של הפנאומוקוק. הנשאות של הסרוטיפים החיסוניים ירדה ואילו הנשאות של שאר הסרוטיפים עלתה ב-12% לשנה.
לא היו הבדלים בהיקפי הנשאות בין הילדים המחוסנים ב-PCV13 לבין הילדים הלא-מחוסנים.
הנשאות של הסרוטיפים של PCV13 הייתה נמוכה ב-70% בקרב ילדים מחוסנים בריאים אך לא בילדים שהיו חולים במחלות דרכי נשימה נגיפיות.
Changes in nasopharyngeal carriage of Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae and Moraxella catarrhalis among healthy children attending a day-care centre before and after official financial support for the 7-valent pneumococcal conjugate vaccine and H. influenzae type b vaccine in Japan.
2014,
Oikawa,
J Infect Chemother
ביפן אחרי תחילת התחסנות נגד Hib ונגד פנאומוקוק הנשאות של הסרוטיפים החיסוניים של הפנאומוקוק ירדה והנשאות של שאר הסרוטיפים עלתה. בספירה כללית היקף הנשאות לא השתנה. היקף הנשאות של המופילוס אינפלואנזה עלה.
Effect of Pneumococcal Conjugate Vaccination on Serotype-Specific Carriage and Invasive Disease in England: A Cross-Sectional Study.
2011,
Flasche,
PLoS Med
באנגליה ירד היקף הנשאות בסרוטיפים החיסוניים ועלה בשאר הסרוטיפים. בספירה כללית היקף הנשאות עלה ב-6% (אין מובהקות סטטיסטית).
Changes in frequency and pathogens causing acute otitis media in 1995-2003.
2004,
Casey,
Pediatr Infect Dis J
התחלואה בדלקת אקוטית של האוזן התיכונה לא השתנתה בין 1995 ל-2003, אך החלק היחסי של דלקת ממושכת ירד מ-16% ל-12%, כשהמופולוס אינפלואנזה החליף את פנאומוקוק כגורם העיקרי לתחלואה (רוצ'סטר, ניו יורק).
Predominance of nontypeable Haemophilus influenzae in children with otitis media following introduction of a 3+0 pneumococcal conjugate vaccine schedule.
2011,
Wiertsema,
Vaccine
פנאומוקוק והמופילוס אינפלואנזה הם "האחראים" ל-80% ממקרי דלקת אקוטית של אוזן תיכונה. החיידק М.catarrhalis גורם ל-3--20% מהמקרים.
אחרי תחילת ההתחסנות רוב מקרי דלקת אוזניים החלו להיגרם ע"י סרוטיפים נטולי קפסולה של המופילוס אינפלואנזה.
Effect of conjugate pneumococcal vaccine followed by polysaccharide pneumococcal vaccine on recurrent acute otitis media: a randomised study.
2003,
Veenhoven,
Lancet
ניסוי אקראי מבוקר כפול-סמיות שחקר את השפעת החיסון נגד פנאומוקוק על דלקת האוזן התיכונה בקרב ילדים בני שנה ומעלה בעלי נטיה לדלקת זו. בתור פלסבו השתמשו בחיסונים נגד הפטיטיס A ו-B.
התחלואה בדלקת האוזן התיכונה בקרב המחוסנים הייתה גבוהה ב-25%, אם כי המובהקות הסטטיסטית הייתה גבולית (CI 0.99-1.57). בקרב ילדים מעל גיל שנתיים החיסון העלה את הסיכון לדלקת אוזניים ב-45%. בילדים שאינם בעלי נטיה לדלקת, החיסון העלה את הסיכון ב-66%.
החיסון לא השפיע על הנשאות של הפנאומוקוק, זאת כיוון שהסרוטיפים החיסוניים הוחלפו ע"י שאר הסרוטיפים. לילדים שחוסנו נגד פנאומוקוק, סטפילוקוקוס זהוב נמצא לעיתים קרובות יותר.